AtomisticSkills — плагин

Плагин и набор из 130 с лишним скиллов для материаловедения: релаксация, молекулярная динамика, DFT и базы структур через MCP.

  • 187 ★ репозитория
  • Последний коммит
  • MIT
Плагин

Расширенный доступ

Почему такой уровень

  • Расчеты запускают тяжелый код и скачивают данные из внешних баз на вашей машине.
Все причины и проверки

learningmatter-mit/atomisticskills

Установка

В терминале, через SkillFoxx CLI

npx skillfoxx add plugins/atomisticskills

Определит агенты на машине, покажет уровень доступа и зафиксирует версию.

Другие способы установки

Доступ и проверки

Как мы проверяем

Расширенный доступИнструмент запускает код или ходит в сеть, а внешние данные только читает.

  • Расчеты запускают тяжелый код и скачивают данные из внешних баз на вашей машине.

Это чужой код. Посмотрите файлы в репозитории перед установкой.

Что делает

AtomisticSkills — каркас для исследований в атомистическом материаловедении, где агент складывает задачи из трех уровней: инструменты, скиллы и рабочие процессы. Инструменты — строгие функции Python за MCP-серверами: релаксация структур, молекулярная динамика в ансамблях NVT, NPT и NVE, симуляции Монте-Карло, подготовка и разбор DFT-расчетов, потенциалы машинного обучения. Скиллы — гибкие инструкции, которые комбинируют вызовы: бенчмарк потенциалов, коэффициенты диффузии, термодинамическая устойчивость, докинг в AutoDock Vina, изотермы адсорбции методом GCMC. В каталоге `skills/` больше ста скиллов с `SKILL.md`, вспомогательными скриптами и примерами, а в `.agents/workflows` лежат высокоуровневые планы исследований. Плагин для Claude Code ставит скиллы и MCP-серверы сразу настроенными, а для Codex, Cursor, Gemini, Windsurf и Antigravity есть скрипт `configure_mcp.py`. Расчеты идут через лаунчер `venv/run` в трех окружениях `uv`.

Для кого. Исследователям в вычислительной химии и материаловедении, которые хотят поручить агенту расчеты по готовым методикам вместо написания скриптов под каждую задачу.

Подходит, если

  • Нужно сравнить точность потенциалов машинного обучения на размеченном наборе с графиком паритета.
  • Коэффициент диффузии и энергию активации считают по траектории молекулярной динамики.
  • Лиганд стыкуют с белком через AutoDock Vina.
  • Агент строит кластерное разложение и запускает Монте-Карло по готовому рецепту.

Не подходит, если

  • Рабочая машина на macOS или Windows: заявлены Linux x86_64 и aarch64.
  • Задача лежит вне материаловедения и вычислительной химии.
  • Нужны расчеты без установки окружений `uv` и тяжелых зависимостей.

Пример запроса к агенту

Рассчитай коэффициент диффузии лития по траектории молекулярной динамики и покажи энергию активации с графиком.

Ограничения

Заявлена только ОС Linux на x86_64 или aarch64, нужна glibc 2.28 и новее, а для GPU-стека на aarch64 версия 2.34. Первичная настройка выполняется командой `venv/run --setup` и скачивает окружения `cpu`, `mlip` и `fairchem`: нужны время и место на диске. Расчеты и скачивание внешних баз данных идут с вашей машины, результаты нужно проверять специалисту. Описание проверено по README на момент октября 2026 года.

Как отключить. Выполните `claude plugin uninstall atomistic-skills@atomistic-skills`. Для клонированной копии удалите каталог и записи MCP, добавленные `configure_mcp.py`.

Частые вопросы

Чем отличаются инструменты, скиллы и рабочие процессы?

Инструменты: строгие функции за MCP. Скиллы: гибкие инструкции из нескольких вызовов. Рабочие процессы: исследовательские планы на несколько этапов.

Как поставить для Codex или Cursor?

Склонируйте репозиторий, выполните `venv/run --setup`, затем `python configure_mcp.py --agent codex --scope global` (или `cursor`, `gemini`, `windsurf`).

Что запускается в контейнерах?

Плагин использует нативный `uv`, когда система подходит, и переходит на готовые контейнерные образы, если требования не выполнены.

Есть ли тесты качества?

У проекта есть отдельный бенчмарк с таблицей лидеров и репозиторий оценки. Ссылки приведены в начале README.

Нужна ли видеокарта?

Необязательна. Окружение `cpu` обходится без нее, тяжелые стеки `mlip` и `fairchem` рассчитаны на GPU.

Обсуждение

Вопросов и отзывов пока нет.

Плагины

24 скилла по численным методам и материаловедению: агент проверяет устойчивость, сетки, сходимость и запуски на кластере.

ПлагинРасширенный доступ83Звезды репозитория

Скиллы для расчетов в вычислительной химии: ASE, VASP-подобные DFT-коды, LAMMPS, DeePMD, RDKit, Open Babel и другие, для OpenClaw

СкиллРасширенный доступ156Звезды репозитория

Около 200 скиллов для Claude Code по биоинформатике, химии и биостатистике: от анализа РНК-секвенирования до докинга молекул

СкиллРасширенный доступ388Звезды репозитория

18 скиллов и MCP-сервер на 34 инструмента по 3D Gaussian Splatting: разбор статей, сравнение методов, отладка обучения и рендер.

ПлагинРасширенный доступ184Звезды репозитория

Навыки для расчетов энергосистем: порядок работы с pandapower, OpenDSS, PSS/E, PowerWorld и плейбуки устранения нарушений режима.

ПлагинМинимальный доступ80Звезды репозитория

Плагин для Claude Code и MCP-сервер: более 1000 научных инструментов для биологии, химии и медицины, команды для сверки данных и скиллы-маршрутизаторы

ПлагинШирокий доступ1,8 тыс.Звезды репозитория

Коротко о README

Три уровня абстракции с 130 с лишним скиллами и MCP-инструментами в одном плагине для вычислительной химии.

Бейдж для README

Сообщить о проблеме