Agent Skills for Healthcare and Life Sciences
43 скилла для медицины и наук о жизни: геномика, клинические данные, разработка лекарств, CDISC и расчеты по страховым выплатам
- 76 ★ репозитория
- Последний коммит
- MIT-0
Минимальный доступ
Почему такой уровень
- Скиллы описывают методики и команды и сами ничего не выполняют, но агент по ним запускает биоинформатические инструменты и работает с медицинскими данными
Установка
- Работает в
Ручная установка
npx skills add awslabs/hcls-agent-skillsДля Claude Code, Cursor, Codex и других агентов. Для Kiro и Claude Code есть и `./install.sh --target <платформа>` из локальной копии.
Доступ и проверки
Как мы проверяемМинимальный доступИнструмент ничего не запускает и не ходит в сеть.
- Скиллы описывают методики и команды и сами ничего не выполняют, но агент по ним запускает биоинформатические инструменты и работает с медицинскими данными
Это чужой код. Посмотрите файлы в репозитории перед установкой.
Что делает
Коллекция из 43 скиллов для процессов в здравоохранении и науках о жизни, оформленная по открытому стандарту Agent Skills. Скиллы бывают двух видов. Рассуждающие кодируют методику и правила принятия решений: классификация вариантов по ACMG, эмуляция целевого исследования, спецификация мер HEDIS. Конвейерные содержат команды и таблицы параметров для запуска: вызов вариантов GATK4, хеминформатика на RDKit, разбор сообщений HL7v2. Области покрывают геномику, одноклеточный анализ, медицинскую визуализацию, структуру белков, трансляционные исследования, фармакоэпидемиологию на реальных данных, клинические данные, разработку лекарств, протеомику, проверку клинических данных, мультиомику, операции здравоохранения, регуляторику и архитектуру AWS. Среди скиллов `variant-calling`, `rna-seq-analysis`, `scrna-seq-pipeline`, `molecular-docking`, `dicom-processing`, `cdisc-compliance`, `risk-adjustment` и `claims-billing-rules`. По сравнению на 410 запросах, где судил Claude Opus 4.7, скиллы выигрывают у ответов без них в 70–86 процентах случаев в зависимости от среды. Установка идет командой `npx skills add awslabs/hcls-agent-skills` или скриптом `./install.sh --target <платформа>` для Kiro и Claude Code.
Для кого. Биоинформатикам, эпидемиологам, специалистам по клиническим данным и страховой аналитике, которые работают с ИИ-агентом и хотят проверенные методики вместо общих знаний модели.
Подходит, если
- Нужно классифицировать вариант по критериям ACMG и собрать доказательства из ClinVar
- Конвейер вызова вариантов или RNA-seq надо собрать с BWA-MEM2, GATK4 и DESeq2
- Клинические данные приводят к стандартам CDISC: SDTM, ADaM и define.xml
- Из страховых выплат нужно посчитать RAF и найти разрывы кодирования по HCC
- Файлы DICOM преобразуют в NIfTI, обезличивают и раскладывают по BIDS
Не подходит, если
- Нужно клиническое решение о пациенте: набор помогает с методикой, а решение остается за специалистом
- Задача вне перечисленных областей: у скиллов узкая специализация
- Нужна единая среда исполнения: скиллы описывают процедуры и команды, но сами ничего не запускают
Пример запроса к агенту
Классифицируй этот вариант по критериям ACMG, собери доказательства из ClinVar и оформи заключение с уровнями уверенности.Ограничения
Скиллы описывают методики и команды, а запуск и проверка результатов остаются за пользователем и его средой. Для конвейерных скиллов нужны соответствующие инструменты: GATK4, STAR, Scanpy, RDKit, AutoDock Vina, TIAToolbox и другие. Скиллы с кодами и правилами выплат нужно сверять с актуальными версиями: коэффициенты HCC и критерии меняются. В регулируемых областях выводы проверяет специалист. Установка через `install.sh` рассчитана на платформы Kiro, Claude Code и Quick Desktop, остальные берут `npx skills add`.
Как отключить. Удалите установленные скиллы командой `npx skills remove` или удалите папки из `.claude/skills/` или `~/.kiro/skills/`. Конфигурацию агента из `~/.kiro/agents/` стирают вручную.
Частые вопросы
Как установить скиллы?
Командой `npx skills add awslabs/hcls-agent-skills` для большинства агентов или `./install.sh --target claude-code` и `./install.sh --target kiro` из локальной копии.
Чем рассуждающие скиллы отличаются от конвейерных?
Рассуждающие задают методику и критерии решения, например ACMG и целевое исследование. Конвейерные дают команды и параметры для запуска, например GATK4 и RDKit.
Какие области покрыты?
Геномика, одноклеточный анализ, визуализация, белки, фармакоэпидемиология, клинические данные, лекарства, протеомика, мультиомика, операции, регуляторика и AWS.
Заменяют ли скиллы специалиста?
Нет. Они дают методику и команды для агента, а выводы в регулируемых областях проверяет специалист.
С какими платформами работает набор?
Kiro, Amazon Quick, Amazon Bedrock AgentCore, AWS Strands SDK, Claude Code, Codex, CrewAI, LangChain и более двадцати других.
Обсуждение
Вопросов и отзывов пока нет.
Похожие
СкиллыSciAgent-Skills — скиллы по биоинформатике
SciAgent-Skills
Около 200 скиллов для Claude Code по биоинформатике, химии и биостатистике: от анализа РНК-секвенирования до докинга молекул
Плагин hcls-agents от AWS дает Claude Code и Codex навыки по геномике, клиническим испытаниям и биомаркерам и MCP-серверы.
17 скиллов для вычислительной биологии: RNA-seq, одноклеточный анализ, структуры белков, докинг, литература и графики
166 скиллов для научных задач: биоинформатика, хемоинформатика, клинические данные, геоданные и доступ к более чем 100 базам
37 скиллов для вычислительной химии и биологии лекарств: от поиска мишени и докинга до ADMET и клинической истории.
Шаблон для аналитиков данных: AGENTS.md, CLAUDE.md и набор скиллов по Python, SQL, Polars и диагностике моделей.
Коротко о README
Описаны два вида скиллов, области с таблицами скиллов, результаты сравнения на 410 запросах, установка скриптом и через CLI skills и режим нескольких агентов для Kiro.