SkillFoxx
Telegram

Drug Discovery Agent Skills — плагин

37 скиллов для вычислительной химии и биологии лекарств: от поиска мишени и докинга до ADMET и клинической истории.

  • 55 ★ репозитория
  • Последний коммит
  • MIT
Плагин

Расширенный доступ

Почему такой уровень

  • Скрипты скиллов запускаются на вашей машине и ходят во внешние API с вашими ключами.
  • Результаты расчетов исследовательские, их проверяет эксперт.
Все причины и проверки

k-dense-ai/drug-discovery-agent-skillsАвтор:K-Dense

Установка

Работает в

Ручная установка

npx skills add K-Dense-AI/drug-discovery-agent-skills

Находит установленные хосты агентов и ставит скиллы там. Вариант: `gh skill install K-Dense-AI/drug-discovery-agent-skills`.

Доступ и проверки

Как мы проверяем

Расширенный доступИнструмент запускает код или ходит в сеть, а внешние данные только читает.

  • Скрипты скиллов запускаются на вашей машине и ходят во внешние API с вашими ключами.
  • Результаты расчетов исследовательские, их проверяет эксперт.

Это чужой код. Посмотрите файлы в репозитории перед установкой.

Что делает

Набор из 37 скиллов учит кодинг-агента работать с инструментами вычислительных химиков и биологов: как их ставить, какое API вызывать, что значат параметры и где они ломаются. Покрыты проверка мишеней и генетика человека, биоактивность и доступные для покупки соединения, генеративный дизайн и ретросинтез, докинг, свободная энергия и динамика, `ADMET` и оценка дозы, белки, антитела, деградеры и олигонуклеотиды, клиническая и регуляторная история. Скиллы складываются в цепочки: один запрос часто подтягивает два-три, например `open-targets`, `depmap` и `chembl`. В таблице для каждого указано, что нужно: работает локально, обращается к публичному API без ключа, требует ключ или `GPU.` Репозиторий соответствует стандартам `Agent Skills` и `Agent Plugins` 1.0.0.

Для кого. Вычислительным химикам, биоинформатикам и ученым-медикам, которые поручают агенту рутину поиска данных и предварительных расчетов.

Подходит, если

  • Нужно выяснить, какие мишени при астме имеют генетические доказательства и доступны малым молекулам.
  • Из `ChEMBL` собирают чистый набор `IC50` для `EGFR` и считают, сколько данных пришлось отбросить.
  • Для структуры `EGFR` с ингибитором проверяют, что сайт АТФ разрешен полностью.
  • Перед синтезом смотрят, не заявлена ли серия соединений в патентах.

Не подходит, если

  • Нужны клинические решения для пациента: набор рассчитан на исследовательскую работу.
  • Нет желания давать агенту доступ к сети и ключам `API.`
  • Расчеты на GPU недоступны, а нужны докинг и фолдинг крупных комплексов.

Пример запроса к агенту

Какие мишени при астме имеют генетические доказательства, доступны малым молекулам и не критичны для всех клеток? Покажи источники.

Ограничения

Скиллы дают инструкции, а скрипты исполняются на вашей машине с доступом к файлам, переменным окружения и сети, поэтому до установки изучите `SKILL.md` нужных инструментов и отчет `docs/security-report.md`. Часть скиллов использует публичные API без ключа, часть требует собственных ключей, например `Adaptyv`, `ESM Forge`, `Rowan` и `Tamarind.` Для ряда инструментов, скажем `Boltz-2`, практически нужен GPU, у некоторых есть верхняя граница версии `Python.` Результаты расчетов проверяйте экспертом, это не медицинская рекомендация.

Как отключить. Удалите установленный каталог скиллов командой своей среды, например удалите `~/.agents/skills/drug-discovery-agent-skills`. Ключи API уберите из переменных окружения.

Частые вопросы

Какие способы установки есть?

`npx skills add K-Dense-AI/drug-discovery-agent-skills`, `gh skill install` с закреплением версии, плагин для `Cursor` или `Codex` и обычный `git clone` в каталог навыков.

Что значит столбец `Needs`?

Он показывает, что нужно скиллу: локальный запуск, публичный API без ключа, свой ключ или GPU, а также ограничения по версии `Python.`

Как закрепить версию?

Командой `gh skill install K-Dense-AI/drug-discovery-agent-skills --pin v1.3.0` или клонированием тега `v1.3.0`.

Нужны ли ключи API?

Для части скиллов нет, публичные базы вроде `ChEMBL` и `Open Targets` доступны без ключа. Другие, например `Adaptyv` и `Rowan`, требуют свои ключи.

Работает ли в других агентах?

Да, авторы называют `Claude Code`, `Cursor`, `Codex` и `Google Antigravity.` Репозиторий оформлен как `Agent Plugins` 1.0.0.

Обсуждение

Вопросов и отзывов пока нет.

Плагины

Около 200 скиллов для Claude Code по биоинформатике, химии и биостатистике: от анализа РНК-секвенирования до докинга молекул

СкиллРасширенный доступ388
Выбор редакции

166 скиллов для научных задач: биоинформатика, хемоинформатика, клинические данные, геоданные и доступ к более чем 100 базам

СкиллРасширенный доступ57 тыс.

Скиллы для расчетов в вычислительной химии: ASE, VASP-подобные DFT-коды, LAMMPS, DeePMD, RDKit, Open Babel и другие, для OpenClaw

СкиллРасширенный доступ157

17 скиллов для вычислительной биологии: RNA-seq, одноклеточный анализ, структуры белков, докинг, литература и графики

СкиллРасширенный доступ75
Официальный

43 скилла для медицины и наук о жизни: геномика, клинические данные, разработка лекарств, CDISC и расчеты по страховым выплатам

СкиллМинимальный доступ76

Библиотека скиллов для медицинских исследований: поиск и разбор литературы, планирование исследований, анализ данных и написание научных статей

СкиллРасширенный доступ2 тыс.

Коротко о README

В README перечислены 37 скиллов по группам с указанием требований, три способа установки, примеры вопросов, предупреждение о безопасности и версия 1.3.0.

Бейдж для README

Сообщить о проблеме