ClawBio — плагин
ClawBio — 110 скиллов для агентов по биоинформатике: геномика, фармакогеномика и популяционная генетика с воспроизводимостью.
- 1 182 ★ репозитория
- Последний коммит
Расширенный доступ
Почему такой уровень
- Скиллы запускают Python-анализы над геномными файлами и обращаются к публичным базам данных.
Установка
- Работает в
В терминале, через SkillFoxx CLI
npx skillfoxx add plugins/clawbioОпределит агенты на машине, покажет уровень доступа и зафиксирует версию.
Другие способы установки
Доступ и проверки
Как мы проверяемРасширенный доступИнструмент запускает код или ходит в сеть, а внешние данные только читает.
- Скиллы запускают Python-анализы над геномными файлами и обращаются к публичным базам данных.
Это чужой код. Посмотрите файлы в репозитории перед установкой.
Что делает
ClawBio собирает скиллы формата Agent Skills для задач биоинформатики. В каталоге `skills/` лежат отдельные папки: анализ FASTA, приоритизация клинических вариантов, оценка CNV по ACMG, поиск клинических испытаний, загрузка данных из ENA и ArrayExpress, фармакогеномика по фото упаковки лекарства и другие, всего 110 по `skills/catalog.json`. Установка: `pip install clawbio` и запуск `clawbio run pharmgx --demo`, пакет доступен и из bioconda. Для Claude Code есть плагин `/plugin marketplace add ClawBio/ClawBio`. Cursor, VS Code, Codex и Zed читают те же папки из `~/.agents/skills/` или `.agents/skills/` проекта. Проект работает локально, и многие анализы пишут в папку `reproducibility/` команды повтора, сведения об окружении и контрольные суммы результатов. Сервер MCP объявлен устаревшим с версии 0.7.0 и удаляется в 0.8.0.
Для кого. Биоинформатикам и исследователям генетики, которые готовят анализ данных вместе с агентом и хотят воспроизводимый результат.
Подходит, если
- Из VCF-файла надо получить фармакогенетический отчет с дозировками по генотипу.
- Для списка вариантов нужны связи с болезнями из девяти баз сразу.
- Результат анализа должен пересчитываться по сохраненным командам и контрольным суммам.
- Данные пациентов нельзя отправлять в облако, и все считается на своей машине.
Не подходит, если
- Нужно клиническое решение: отчеты служат исследовательскими подсказками, а не медицинским заключением.
- Доступ к MCP-серверу ClawBio: он удален в 0.8.0.
- Нужны полные демонстрационные данные: для них ставят из исходников, а не из пакета.
Пример запроса к агенту
Запусти демо `clawbio run pharmgx --demo` и объясни по шагам, какие гены и препараты попали в отчет.Ограничения
ClawBio служит исследовательским инструментом и не заменяет врача: фармакогенетические карточки с рекомендациями нужно сверять с клиническими источниками. Для установки требуется Python 3.12 или новее. Часть повторов анализа зависит от внешних баз и сервисов, которые должны быть доступны. Полный набор демоданных лежит в исходниках, а пакет их урезает. MCP-сервер удален из версии 0.8.0, вместо него используются сами скиллы. Лицензия в API GitHub не определена, проверьте файл LICENSE в репозитории. Последний коммит сделан в ноябре 2026.
Как отключить. Для плагина выполните `/plugin` и удалите ClawBio, для пакета `pip uninstall clawbio`. Скопированные папки из `skills/` удалите из `~/.agents/skills/` вручную.
Частые вопросы
Как поставить ClawBio?
Выполните `pip install clawbio` (Python 3.12 или новее) или `conda install -c bioconda clawbio`. Для Claude Code: `/plugin marketplace add ClawBio/ClawBio`.
Как подключить скиллы в Cursor или Codex?
Скопируйте или залинкуйте нужные папки из `skills/` в `~/.agents/skills/` или `.agents/skills/` проекта, сервер не нужен.
Как использовать как библиотеку?
Импортируйте `from clawbio import run_skill, list_skills` и вызовите `run_skill("pharmgx", demo=True)`.
Что с MCP-сервером?
Команда `clawbio mcp` объявлена устаревшей в 0.7.0 и удалена в 0.8.0. Порядок перехода описан в документации на docs.clawbio.ai.
Откуда данные, и уходят ли они в облако?
По умолчанию анализ идет локально. Часть скиллов обращается к публичным базам, например при поиске ассоциаций варианта.
Обсуждение
Вопросов и отзывов пока нет.
Похожие
ПлагиныSciAgent-Skills — скиллы по биоинформатике
SciAgent-Skills
Около 200 скиллов для Claude Code по биоинформатике, химии и биостатистике: от анализа РНК-секвенирования до докинга молекул
17 скиллов для вычислительной биологии: RNA-seq, одноклеточный анализ, структуры белков, докинг, литература и графики
Плагин для Claude Code и MCP-сервер: более 1000 научных инструментов для биологии, химии и медицины, команды для сверки данных и скиллы-маршрутизаторы
43 скилла для медицины и наук о жизни: геномика, клинические данные, разработка лекарств, CDISC и расчеты по страховым выплатам
StatsClaw собирает команду из девяти агентов Claude Code для разработки статистических пакетов по статье или формулам.
166 скиллов для научных задач: биоинформатика, хемоинформатика, клинические данные, геоданные и доступ к более чем 100 базам
Коротко о README
Python-пакет и набор скиллов для биоинформатики на основе OpenClaw. В репозитории лежат каталог `skills/catalog.json`, плагин Claude Code и справка docs.clawbio.ai.