Medical Research Agent Skills

Библиотека скиллов для медицинских исследований: поиск и разбор литературы, планирование исследований, анализ данных и написание научных статей

Скилл

Средний риск

Средний уровень ставим, когда инструмент запускает код, ходит в сеть или читает файлы проекта. Перед установкой посмотрите, что именно он делает.

Почему такой уровень

  • Генерирует код анализа на R и Python и запускает скрипты, работающие с данными
  • Часть скиллов обращается к внешним базам, а выводы это исследовательская помощь, которую нужно проверять, а не клиническое решение
Все причины и проверки

aipoch/medical-research-skills

Установка

В терминале, через SkillFoxx CLI

npx skillfoxx add skills/medical-research-agent-skills

Определит агенты на машине, проверит риск и зафиксирует версию.

Другие способы установки

Собрано автоматически, проверьте перед установкой.

Выполните в терминале в папке проекта

npx skills add aipoch/medical-research-skills --skill arxiv-preflight author-response-builder claim-strength-calibrator conference-abstract-writer consistency-checker-across-manuscript cover-letter-drafter discussion-composer figure-legend-writer grant-specific-aims-writer graphical-abstract-generator introduction-logic-builder introduction-section-writer latex-manuscript-format-converter lay-summary-for-cross-disciplinary-teams limitation-and-risk-writer medical-english-precision-editor methods-section-writer -a claude-code -y

Утилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.

Выполните в терминале в папке проекта

npx skills add aipoch/medical-research-skills --skill arxiv-preflight author-response-builder claim-strength-calibrator conference-abstract-writer consistency-checker-across-manuscript cover-letter-drafter discussion-composer figure-legend-writer grant-specific-aims-writer graphical-abstract-generator introduction-logic-builder introduction-section-writer latex-manuscript-format-converter lay-summary-for-cross-disciplinary-teams limitation-and-risk-writer medical-english-precision-editor methods-section-writer -a cursor -y

Утилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.

Выполните в терминале в папке проекта

npx skills add aipoch/medical-research-skills --skill arxiv-preflight author-response-builder claim-strength-calibrator conference-abstract-writer consistency-checker-across-manuscript cover-letter-drafter discussion-composer figure-legend-writer grant-specific-aims-writer graphical-abstract-generator introduction-logic-builder introduction-section-writer latex-manuscript-format-converter lay-summary-for-cross-disciplinary-teams limitation-and-risk-writer medical-english-precision-editor methods-section-writer -a github-copilot -y

Утилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.

Выполните в терминале в папке проекта

npx skills add aipoch/medical-research-skills --skill arxiv-preflight author-response-builder claim-strength-calibrator conference-abstract-writer consistency-checker-across-manuscript cover-letter-drafter discussion-composer figure-legend-writer grant-specific-aims-writer graphical-abstract-generator introduction-logic-builder introduction-section-writer latex-manuscript-format-converter lay-summary-for-cross-disciplinary-teams limitation-and-risk-writer medical-english-precision-editor methods-section-writer -a codex -y

Утилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.

Выполните в терминале в папке проекта

npx skills add aipoch/medical-research-skills --skill arxiv-preflight author-response-builder claim-strength-calibrator conference-abstract-writer consistency-checker-across-manuscript cover-letter-drafter discussion-composer figure-legend-writer grant-specific-aims-writer graphical-abstract-generator introduction-logic-builder introduction-section-writer latex-manuscript-format-converter lay-summary-for-cross-disciplinary-teams limitation-and-risk-writer medical-english-precision-editor methods-section-writer -a gemini-cli -y

Утилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.

Выполните в терминале в папке проекта

npx skills add aipoch/medical-research-skills --skill arxiv-preflight author-response-builder claim-strength-calibrator conference-abstract-writer consistency-checker-across-manuscript cover-letter-drafter discussion-composer figure-legend-writer grant-specific-aims-writer graphical-abstract-generator introduction-logic-builder introduction-section-writer latex-manuscript-format-converter lay-summary-for-cross-disciplinary-teams limitation-and-risk-writer medical-english-precision-editor methods-section-writer -a cline -y

Утилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.

Выполните в терминале в папке проекта

npx skills add aipoch/medical-research-skills --skill arxiv-preflight author-response-builder claim-strength-calibrator conference-abstract-writer consistency-checker-across-manuscript cover-letter-drafter discussion-composer figure-legend-writer grant-specific-aims-writer graphical-abstract-generator introduction-logic-builder introduction-section-writer latex-manuscript-format-converter lay-summary-for-cross-disciplinary-teams limitation-and-risk-writer medical-english-precision-editor methods-section-writer -a roo -y

Утилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.

Форк Roo Code, папки .roo те же.

Выполните в терминале в папке проекта

npx skills add aipoch/medical-research-skills --skill arxiv-preflight author-response-builder claim-strength-calibrator conference-abstract-writer consistency-checker-across-manuscript cover-letter-drafter discussion-composer figure-legend-writer grant-specific-aims-writer graphical-abstract-generator introduction-logic-builder introduction-section-writer latex-manuscript-format-converter lay-summary-for-cross-disciplinary-teams limitation-and-risk-writer medical-english-precision-editor methods-section-writer -a opencode -y

Утилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.

Понадобится: Node.js

Сверено с репозиторием 26 сент. 2026, коммит 686e09d.

Текст для агента

Склонируй репозиторий aipoch/medical-research-skills и скопируй нужные папки из scientific-skills в ~/.claude/skills/. Ставь только те скиллы, которые нужны, например поиск литературы или анализ данных.

Другие способы из описания автора
git clone https://github.com/aipoch/medical-research-skills.git
cp -r "medical-research-skills/scientific-skills/Academic Writing/abstract-summarizer" ~/.claude/skills/

Глобальная установка нужных папок в ~/.claude/skills/. Для одного проекта копируйте в .claude/skills/ проекта. Путь к папке скилла возьмите из дерева репозитория, копируйте только нужные скиллы.

Это чужой код. Посмотрите файлы в репозитории перед установкой.

Что делает

Набор дает агенту большую коллекцию скиллов в формате SKILL.md для работы медицинского исследователя. Скиллы разложены по стадиям работы: поиск и оценка доказательств (построение запросов к PubMed и другим базам, скрининг статей, разметка доказательной базы, поиск пробелов), планирование исследований (выбор дизайна, расчет мощности, план валидации), анализ данных (генерация кода на R и Python для биоинформатики, статистические модели, очистка данных, визуализация) и академическое письмо (черновики разделов статьи, аннотации, сопроводительные письма). Каждый скилл это папка с файлом SKILL.md, где описаны условия запуска и методика, к части скиллов приложены скрипты на Python и материалы в references. В репозитории есть отдельный аудитор скиллов, который прогоняет каждую запись через доменную рамку проверки перед публикацией.

Для кого. Для медицинских и биомедицинских исследователей, аналитиков данных и авторов научных статей, которые работают с агентом на SKILL.md.

Подходит, если

  • Нужно построить стратегию поиска по PubMed и другим базам и просеять литературу
  • Нужно спланировать дизайн исследования, рассчитать мощность или разобрать методологию статьи
  • Нужно сгенерировать код анализа на R или Python и черновики разделов рукописи

Не подходит, если

  • Нужен клинический совет или решение о лечении: набор для исследовательской работы, а не для медицинских рекомендаций
  • Задача не про медицинские исследования

Пример запроса к агенту

Построй стратегию поиска по PubMed для систематического обзора по этому вопросу и просей результаты по дизайну исследований

Ограничения

Это справочный и рабочий инструмент для исследований, а не источник медицинских рекомендаций: выводы, код и тексты нужно проверять самому, они не заменяют врача и клиническое решение. Скиллы и скрипты рассчитаны на Python 3.10 и выше и отдельные библиотеки, часть возможностей без них недоступна. Материал на английском. Часть скиллов ходит в внешние базы и генерирует код, результаты которого требуют проверки.

Как отключить. Удалите скопированные папки скиллов из ~/.claude/skills/ или из .claude/skills/ проекта.

Проверка безопасности

  • Генерирует код анализа на R и Python и запускает скрипты, работающие с данными
  • Часть скиллов обращается к внешним базам, а выводы это исследовательская помощь, которую нужно проверять, а не клиническое решение

Коротко о README

README описывает библиотеку из сотен скиллов для медицинских исследований, сделанных командой AIPOCH и совместимых с Claude Code, Codex и другими платформами на SKILL.md. Скиллы охватывают четыре направления: работа с доказательствами, планирование исследований, анализ данных и академическое письмо, и разложены по стадиям исследования. Каждый скилл перед публикацией проходит доменную проверку MedSkillAudit, отдельный аудитор входит в репозиторий. Часть скиллов включена в открытый рабочий стол AIPOCH Open-Science. Лицензия MIT.

SKILL.md

---
name: abstract-summarizer
description: Transform lengthy academic papers into concise, structured 250-word abstracts.
license: MIT
author: AIPOCH
---
> **Source**: [https://github.com/aipoch/medical-research-skills](https://github.com/aipoch/medical-research-skills)

# Abstract Summarizer

## When to Use

- Use this skill when the task needs Transform lengthy academic papers into concise, structured 250-word abstracts.
- Use this skill for academic writing tasks that require explicit assumptions, bounded scope, and a reproducible output format.
- Use this skill when you need a documented fallback path for missing inputs, execution errors, or partial evidence.

## Key Features

- Scope-focused workflow aligned to: Transform lengthy academic papers into concise, structured 250-word abstracts.
- Packaged executable path(s): `scripts/main.py`.
- Reference material available in `references/` for task-specific guidance.
- Structured execution path designed to keep outputs consistent and reviewable.

Частые вопросы

Это медицинская рекомендация?

Нет. Набор помогает вести исследовательскую работу: поиск литературы, дизайн, анализ и написание статей. Он не дает клинических советов и не заменяет врача, все выводы нужно проверять.

Обязательно ставить всю библиотеку?

Нет. Можно скопировать в каталог скиллов только нужные папки из scientific-skills, например по академическому письму или анализу данных.

Выбор редакции

166 скиллов для научных задач: биоинформатика, хемоинформатика, клинические данные, геоданные и доступ к 100+ базам

СкиллСредний риск47 тыс.Звезды репозитория
Официальный

Открытый MCP-сервер Google для баз данных: готовые инструменты для Postgres, MySQL, BigQuery, Spanner и других, плюс свои инструменты в tools.yaml

MCP-серверВысокий риск16,5 тыс.Звезды репозитория
Выбор редакции

Официальные скиллы Hugging Face: работа с Hub через CLI hf, датасеты, обучение моделей, Spaces, оценка и деплой

СкиллВысокий риск11,1 тыс.Звезды репозитория
Официальный

Язык визуализации для агентов и MCP-сервер: из простой семантической спецификации собираются аккуратные графики

MCP-серверСредний рискБез VPN4,3 тыс.Звезды репозитория
Foxx AIMedical Research Agent Skills

Я Foxx AI и уже разобрал этот инструмент. Спросите про установку, настройку или что угодно еще, отвечу простыми словами.