Science Skills
Набор скиллов Google DeepMind для научных задач: доступ к биологическим и химическим базам, поиск литературы и структурная биология
Средний риск
Средний уровень ставим, когда инструмент запускает код, ходит в сеть или читает файлы проекта. Перед установкой посмотрите, что именно он делает.
Почему такой уровень
- Скиллы запускают скрипты и ходят во внешние научные сервисы
- Часть источников требует ключей API и передает запросы наружу
Установка
В терминале, через SkillFoxx CLI
npx skillfoxx add skills/science-skillsОпределит агенты на машине, проверит риск и зафиксирует версию.
Другие способы установки
Собрано автоматически, проверьте перед установкой.
Выполните в терминале в папке проекта
npx skills add google-deepmind/science-skills --skill alphafold_database_fetch_and_analyze alphagenome_atlas_website_links alphagenome_single_variant_analysis alphagenome_variant_impact_score chembl_database clinical_trials_database clinvar_database credentials dbsnp_database embl_ebi_ols encode_ccres_database ensembl_database foldseek_structural_search gnomad_database gtex_database human_protein_atlas_database interpro_database jaspar_database literature_search_arxiv literature_search_biorxiv literature_search_europepmc literature_search_openalex ncbi_sequence_fetch openfda_database opentargets_database pdb_database predictingthepast protein_sequence_msa protein_sequence_similarity_search pubchem_database pubmed_database pymol quickgo_database reactome_database string_database ucsc_conservation_and_tfbs unibind_database uniprot_database uv workflow_skill_creator -a claude-code -yУтилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.
Выполните в терминале в папке проекта
npx skills add google-deepmind/science-skills --skill alphafold_database_fetch_and_analyze alphagenome_atlas_website_links alphagenome_single_variant_analysis alphagenome_variant_impact_score chembl_database clinical_trials_database clinvar_database credentials dbsnp_database embl_ebi_ols encode_ccres_database ensembl_database foldseek_structural_search gnomad_database gtex_database human_protein_atlas_database interpro_database jaspar_database literature_search_arxiv literature_search_biorxiv literature_search_europepmc literature_search_openalex ncbi_sequence_fetch openfda_database opentargets_database pdb_database predictingthepast protein_sequence_msa protein_sequence_similarity_search pubchem_database pubmed_database pymol quickgo_database reactome_database string_database ucsc_conservation_and_tfbs unibind_database uniprot_database uv workflow_skill_creator -a cursor -yУтилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.
Выполните в терминале в папке проекта
npx skills add google-deepmind/science-skills --skill alphafold_database_fetch_and_analyze alphagenome_atlas_website_links alphagenome_single_variant_analysis alphagenome_variant_impact_score chembl_database clinical_trials_database clinvar_database credentials dbsnp_database embl_ebi_ols encode_ccres_database ensembl_database foldseek_structural_search gnomad_database gtex_database human_protein_atlas_database interpro_database jaspar_database literature_search_arxiv literature_search_biorxiv literature_search_europepmc literature_search_openalex ncbi_sequence_fetch openfda_database opentargets_database pdb_database predictingthepast protein_sequence_msa protein_sequence_similarity_search pubchem_database pubmed_database pymol quickgo_database reactome_database string_database ucsc_conservation_and_tfbs unibind_database uniprot_database uv workflow_skill_creator -a github-copilot -yУтилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.
Выполните в терминале в папке проекта
npx skills add google-deepmind/science-skills --skill alphafold_database_fetch_and_analyze alphagenome_atlas_website_links alphagenome_single_variant_analysis alphagenome_variant_impact_score chembl_database clinical_trials_database clinvar_database credentials dbsnp_database embl_ebi_ols encode_ccres_database ensembl_database foldseek_structural_search gnomad_database gtex_database human_protein_atlas_database interpro_database jaspar_database literature_search_arxiv literature_search_biorxiv literature_search_europepmc literature_search_openalex ncbi_sequence_fetch openfda_database opentargets_database pdb_database predictingthepast protein_sequence_msa protein_sequence_similarity_search pubchem_database pubmed_database pymol quickgo_database reactome_database string_database ucsc_conservation_and_tfbs unibind_database uniprot_database uv workflow_skill_creator -a codex -yУтилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.
Выполните в терминале в папке проекта
npx skills add google-deepmind/science-skills --skill alphafold_database_fetch_and_analyze alphagenome_atlas_website_links alphagenome_single_variant_analysis alphagenome_variant_impact_score chembl_database clinical_trials_database clinvar_database credentials dbsnp_database embl_ebi_ols encode_ccres_database ensembl_database foldseek_structural_search gnomad_database gtex_database human_protein_atlas_database interpro_database jaspar_database literature_search_arxiv literature_search_biorxiv literature_search_europepmc literature_search_openalex ncbi_sequence_fetch openfda_database opentargets_database pdb_database predictingthepast protein_sequence_msa protein_sequence_similarity_search pubchem_database pubmed_database pymol quickgo_database reactome_database string_database ucsc_conservation_and_tfbs unibind_database uniprot_database uv workflow_skill_creator -a gemini-cli -yУтилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.
Выполните в терминале в папке проекта
npx skills add google-deepmind/science-skills --skill alphafold_database_fetch_and_analyze alphagenome_atlas_website_links alphagenome_single_variant_analysis alphagenome_variant_impact_score chembl_database clinical_trials_database clinvar_database credentials dbsnp_database embl_ebi_ols encode_ccres_database ensembl_database foldseek_structural_search gnomad_database gtex_database human_protein_atlas_database interpro_database jaspar_database literature_search_arxiv literature_search_biorxiv literature_search_europepmc literature_search_openalex ncbi_sequence_fetch openfda_database opentargets_database pdb_database predictingthepast protein_sequence_msa protein_sequence_similarity_search pubchem_database pubmed_database pymol quickgo_database reactome_database string_database ucsc_conservation_and_tfbs unibind_database uniprot_database uv workflow_skill_creator -a cline -yУтилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.
Выполните в терминале в папке проекта
npx skills add google-deepmind/science-skills --skill alphafold_database_fetch_and_analyze alphagenome_atlas_website_links alphagenome_single_variant_analysis alphagenome_variant_impact_score chembl_database clinical_trials_database clinvar_database credentials dbsnp_database embl_ebi_ols encode_ccres_database ensembl_database foldseek_structural_search gnomad_database gtex_database human_protein_atlas_database interpro_database jaspar_database literature_search_arxiv literature_search_biorxiv literature_search_europepmc literature_search_openalex ncbi_sequence_fetch openfda_database opentargets_database pdb_database predictingthepast protein_sequence_msa protein_sequence_similarity_search pubchem_database pubmed_database pymol quickgo_database reactome_database string_database ucsc_conservation_and_tfbs unibind_database uniprot_database uv workflow_skill_creator -a roo -yУтилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.
Форк Roo Code, папки .roo те же.
Выполните в терминале в папке проекта
npx skills add google-deepmind/science-skills --skill alphafold_database_fetch_and_analyze alphagenome_atlas_website_links alphagenome_single_variant_analysis alphagenome_variant_impact_score chembl_database clinical_trials_database clinvar_database credentials dbsnp_database embl_ebi_ols encode_ccres_database ensembl_database foldseek_structural_search gnomad_database gtex_database human_protein_atlas_database interpro_database jaspar_database literature_search_arxiv literature_search_biorxiv literature_search_europepmc literature_search_openalex ncbi_sequence_fetch openfda_database opentargets_database pdb_database predictingthepast protein_sequence_msa protein_sequence_similarity_search pubchem_database pubmed_database pymol quickgo_database reactome_database string_database ucsc_conservation_and_tfbs unibind_database uniprot_database uv workflow_skill_creator -a opencode -yУтилита skills ставит текущую версию из репозитория. Чтобы скилл работал во всех проектах, добавьте флаг -g.
Установи набор командой npx skills add google-deepmind/science-skills/. Часть скиллов требует ключа API, добавляй его по подсказке агента, например в ~/.env.
Другие способы из описания автора
npx skills add google-deepmind/science-skills/Ставит набор скиллов в каталог агента. Зависимости обслуживает uv.
Это чужой код. Посмотрите файлы в репозитории перед установкой.
Что делает
Коллекция из более чем тридцати скиллов, которые подключают агента к научным базам данных и инструментам. В наборе доступ к AlphaGenome, базе структур AlphaFold, UniProt, PDB, Ensembl, ChEMBL, PubChem, ClinVar, gnomAD, GTEx и другим ресурсам по геномике, структурной биологии и химии. Отдельная группа скиллов ищет литературу в arXiv, bioRxiv, Europe PMC, OpenAlex и PubMed. Есть скиллы для работы с PyMOL и структурного поиска через Foldseek. Каждый скилл это папка с SKILL.md, вспомогательными скриптами и справочными файлами, зависимости ставятся через uv, часть источников требует ключа API.
Для кого. Для исследователей, биоинформатиков и аналитиков, которые ведут научные задачи через ИИ-агента.
Подходит, если
- Нужно получить данные о гене, белке или соединении из профильной базы
- Нужно найти и разобрать научные статьи по теме
- Нужно проанализировать структуру белка или запустить структурный поиск
Не подходит, если
- Задача не научная и профильные базы не нужны
- Нет доступа к ключам API для источников вроде AlphaGenome и OpenAlex
Пример запроса к агенту
Найди в UniProt данные о белке BRCA1 и подбери свежие статьи по немуОграничения
Скиллы опираются на внешние научные сервисы, доступность и лимиты которых зависят от источника. Часть скиллов, например AlphaGenome и OpenAlex, требует ключа API, другие работают лучше с ключом, но и без него отдают данные. Зависимости ставятся через uv, при первом запуске агент попросит подтверждение на установку. Отдельные источники данных имеют собственные лицензии и условия использования, ответственность за их соблюдение лежит на пользователе. Это не официальный продукт Google.
Как отключить. Удалите установленный набор скиллов из каталога скиллов агента. В Google Antigravity отключите плагин Science в настройках.
Проверка безопасности
- Скиллы запускают скрипты и ходят во внешние научные сервисы
- Часть источников требует ключей API и передает запросы наружу
Коротко о README
README описывает набор скиллов для научной работы по геномике, структурной биологии, химии и поиску литературы. Каждый скилл содержит SKILL.md с инструкциями, папку scripts со вспомогательным кодом и по необходимости references. Набор ставится через npx skills add или подключается как плагин Science в Google Antigravity, зависимости обслуживает uv. Часть скиллов требует ключей API, отдельные источники данных имеют свои лицензии. Код под Apache 2.0, материалы под CC-BY, проект не официальный продукт Google.
SKILL.md
---
name: uniprot-database
description: >-
Access protein metadata, function, taxonomy, and sequences across UniProtKB,
UniParc, and UniRef. Use when searching for proteins, mapping identifiers, or
retrieving functional annotations and publications. Don't use for sequence
alignment, protein folding, or sequence similarity search (use specialized
skills for those tasks).
---
# UniProt Database Access
## Prerequisites
1. **`uv`**: Read the `uv` skill and follow its Setup instructions to ensure
`uv` is installed and on PATH.
2. **User Notification**: If .licenses/uniprot_database_LICENSE.txt does not
already exist in the workspace root directory then (1) prominently notify
the user to check the terms at https://www.uniprot.org/help/license and
https://www.uniprot.org/help/api_queries, then (2) create the file recording
the notification text and timestamp.
## Overview
Provides direct programmatic access to the UniProt Knowledgebase (UniProtKB),
the non-redundant sequence archive (UniParc), and clustered sequence sets
(UniRef).Частые вопросы
Нужен ли Google Antigravity?
Нет. Набор ставится в любой поддерживающий скиллы агент через npx skills add. В Antigravity он же доступен как встроенный плагин Science.
Все ли скиллы требуют ключ?
Нет. Многие базы открыты и работают без ключа. Ключ нужен для AlphaGenome и OpenAlex, а для части источников он лишь повышает лимиты запросов.
Похожие
166 скиллов для научных задач: биоинформатика, хемоинформатика, клинические данные, геоданные и доступ к 100+ базам
Открытый MCP-сервер Google для баз данных: готовые инструменты для Postgres, MySQL, BigQuery, Spanner и других, плюс свои инструменты в tools.yaml
Официальные скиллы Hugging Face: работа с Hub через CLI hf, датасеты, обучение моделей, Spaces, оценка и деплой
Язык визуализации для агентов и MCP-сервер: из простой семантической спецификации собираются аккуратные графики