SkillFoxx
Telegram

Science Skills

Набор скиллов Google DeepMind для научных задач: доступ к биологическим и химическим базам, поиск литературы и структурная биология

  • 3 466 ★ репозитория
  • Последний коммит
  • Apache-2.0
СкиллВыбор редакции

Расширенный доступ

Почему такой уровень

  • Скиллы запускают скрипты и ходят во внешние научные сервисы
  • Часть источников требует ключей API и передает запросы наружу
Все причины и проверки

google-deepmind/science-skillsАвтор:Google DeepMind

Установка

В терминале, через SkillFoxx CLI

npx skillfoxx add skills/science-skills

Определит агенты на машине, покажет уровень доступа и зафиксирует версию.

Другие способы установки

Доступ и проверки

Как мы проверяем

Расширенный доступИнструмент запускает код или ходит в сеть, а внешние данные только читает.

  • Скиллы запускают скрипты и ходят во внешние научные сервисы
  • Часть источников требует ключей API и передает запросы наружу

Это чужой код. Посмотрите файлы в репозитории перед установкой.

Что делает

Коллекция из более чем тридцати скиллов, которые подключают агента к научным базам данных и инструментам. В наборе доступ к AlphaGenome, базе структур AlphaFold, UniProt, PDB, Ensembl, ChEMBL, PubChem, ClinVar, gnomAD, GTEx и другим ресурсам по геномике, структурной биологии и химии. Отдельная группа скиллов ищет литературу в arXiv, bioRxiv, Europe PMC, OpenAlex и PubMed. Есть скиллы для работы с PyMOL и структурного поиска через Foldseek. Каждый скилл это папка с SKILL.md, вспомогательными скриптами и справочными файлами, зависимости ставятся через uv, часть источников требует ключа API.

Для кого. Для исследователей, биоинформатиков и аналитиков, которые ведут научные задачи через ИИ-агента.

Подходит, если

  • Нужно получить данные о гене, белке или соединении из профильной базы
  • Нужно найти и разобрать научные статьи по теме
  • Нужно проанализировать структуру белка или запустить структурный поиск

Не подходит, если

  • Задача не научная и профильные базы не нужны
  • Нет доступа к ключам API для источников вроде AlphaGenome и OpenAlex

Пример запроса к агенту

Найди в UniProt данные о белке BRCA1 и подбери свежие статьи по нему

Ограничения

Скиллы опираются на внешние научные сервисы, доступность и лимиты которых зависят от источника. Часть скиллов, например AlphaGenome и OpenAlex, требует ключа API, другие работают лучше с ключом, но и без него отдают данные. Зависимости ставятся через uv, при первом запуске агент попросит подтверждение на установку. Отдельные источники данных имеют собственные лицензии и условия использования, ответственность за их соблюдение лежит на пользователе. Это не официальный продукт Google.

Как отключить. Удалите установленный набор скиллов из каталога скиллов агента. В Google Antigravity отключите плагин Science в настройках.

Частые вопросы

Нужен ли Google Antigravity?

Нет. Набор ставится в любой поддерживающий скиллы агент через npx skills add. В Antigravity он же доступен как встроенный плагин Science.

Все ли скиллы требуют ключ?

Нет. Многие базы открыты и работают без ключа. Ключ нужен для AlphaGenome и OpenAlex, а для части источников он лишь повышает лимиты запросов.

Обсуждение

Вопросов и отзывов пока нет.

Скиллы

17 скиллов для вычислительной биологии: RNA-seq, одноклеточный анализ, структуры белков, докинг, литература и графики

СкиллРасширенный доступ75
Выбор редакции

166 скиллов для научных задач: биоинформатика, хемоинформатика, клинические данные, геоданные и доступ к более чем 100 базам

СкиллРасширенный доступ57 тыс.

Около 200 скиллов для Claude Code по биоинформатике, химии и биостатистике: от анализа РНК-секвенирования до докинга молекул

СкиллРасширенный доступ388

Библиотека скиллов для медицинских исследований: поиск и разбор литературы, планирование исследований, анализ данных и написание научных статей

СкиллРасширенный доступ2 тыс.
Официальный

Скиллы NVIDIA для биологии и химии: агент предсказывает структуры белков, стыкует молекулы, проектирует белки и разбирает геномы

СкиллРасширенный доступ508

37 скиллов для вычислительной химии и биологии лекарств: от поиска мишени и докинга до ADMET и клинической истории.

ПлагинРасширенный доступ55

Коротко о README

README описывает набор скиллов для научной работы по геномике, структурной биологии, химии и поиску литературы. Каждый скилл содержит SKILL.md с инструкциями, папку scripts со вспомогательным кодом и по необходимости references. Набор ставится через npx skills add или подключается как плагин Science в Google Antigravity, зависимости обслуживает uv. Часть скиллов требует ключей API, отдельные источники данных имеют свои лицензии. Код под Apache 2.0, материалы под CC-BY, проект не официальный продукт Google.

Бейдж для README

Исходный SKILL.md

---
name: uniprot-database
description: >-
  Access protein metadata, function, taxonomy, and sequences across UniProtKB,
  UniParc, and UniRef. Use when searching for proteins, mapping identifiers, or
  retrieving functional annotations and publications. Don't use for sequence
  alignment, protein folding, or sequence similarity search (use specialized
  skills for those tasks).
---

# UniProt Database Access

## Prerequisites

1.  **`uv`**: Read the `uv` skill and follow its Setup instructions to ensure
    `uv` is installed and on PATH.
2.  **User Notification**: If .licenses/uniprot_database_LICENSE.txt does not
    already exist in the workspace root directory then (1) prominently notify
    the user to check the terms at https://www.uniprot.org/help/license and
    https://www.uniprot.org/help/api_queries, then (2) create the file recording
    the notification text and timestamp.

## Overview

Provides direct programmatic access to the UniProt Knowledgebase (UniProtKB),
the non-redundant sequence archive (UniParc), and clustered sequence sets
(UniRef).

Сообщить о проблеме